云门宗在北宋时相当活跃，与临济宗并驾齐驱。　　　　文偃弟子有香林澄远、德山缘密、白云子祥等，而以澄远为上首。澄远传智门光祚。光祚门风险峻，弟子众多，著名的有雪窦重显、延庆子荣、南华宝缘等，进入云门中兴时期。　　　　重显(980-1052)，俗姓李，遂州(今四川遂宁)人。幼年出家，后投光祚，参学五年，尽得其法。一日问曰：不起一念，云何有过？光祚以拂子打之，遂豁然开悟。此后又游历各地，于乾兴元年(1022)住明州雪窦山资圣寺，长达三十一年。其时宗风大振，天下龙蟠凤逸，衲子争集，号云门中兴(《佛祖历代通载》卷十八)。他受汾阳善昭影响，撰有《颂古百则》，把宋初的颂古之风推向高潮，对文字禅有推波助澜之功。故后来心闻昙贲禅师指责说：雪窦以辩博之才，美意变弄，求新逐巧，继汾阳为《颂古》，笼络当世学者，宗风由此一变。(《禅林宝训》)他还著有《瀑泉集》、《祖英集》、《颂古集》、《拈古集》、《洞庭录》、《开堂录》等多种。其得法弟子有八十余人，而以天衣义怀为上首。　　　　义怀(989-1060)，俗姓陈，永嘉乐清(今属浙江)人。受重显印可后，先住无为(今属安徽)铁佛寺，又住越州(今浙江绍兴)天衣寺。他主张禅净一致、禅教融合。门庭十分兴盛，得法弟子有八十余人。重要法嗣有慧林宗本、法云法秀等。宗本(1020-1099)，俗姓管，常州无锡(今属江苏)人。十九岁出家，得法后，先住苏州瑞光寺，后住杭州净慈寺。元丰五年(1082)，奉诏住汴京(今河南开封)慧林寺，受神宗召见。法秀(1027-1090)，俗姓亭，秦州陇城(今甘肃秦安)人。十九岁试经得度，于义怀处证悟，受印可。曾于江苏、江西一带住持寺院多处，后应诏住汴京法云寺。　　　　延庆子荣门下著名禅师有圆通居讷。居讷(1010-1071)，俗姓蹇，梓州中江(今属四川)人。十一岁出家，因参子荣而密契心要。停留十年，道望日重。先后住持庐山归宗寺和圆通寺。庆历四年(1044)，欧阳修被贬滁州后游览庐山，与居讷相见论道，因居讷出入百家而折衷于佛法，使之肃然心服。皇祐(1049-1053)初，有诏请他住持汴京净因寺，他以疾坚辞，并举大觉怀琏以代。　　　　佛印了元(1032-1098)是开先善暹弟子，宋神宗时的云门宗著名禅僧。他俗姓林，饶州浮梁(今属江西)人。未入佛门前，业已五经略通大义，精通儒学，擅长诗文书法。曾住持庐山归宗寺、镇江金山寺、江西云居寺等，凡四十年间，德化缁素，缙绅之贤者多与之游(《佛祖历代通载》卷一九)。他与苏轼兄弟、黄庭坚等著名文人交往甚深，应酬文字颇多。他还与理学家周敦颐结青松社，自为社主。两人相与讲道，为方外友。神宗曾赐高丽磨衲、金钵。　　　　契嵩是北宋云门宗的另一重要禅师。他除了著有《辅教编》，还著有《传法正宗记》、《传法正宗论》、《传法正宗定祖图》，以确定禅宗二十八祖说。　　　　自东汉起，印度、中亚以及西域一带来我国译经传教的僧侣日渐增多，他们曾带来有关佛教传法世系的传说，这些在我国佛教史籍中不乏载录。其中与禅宗有直接关系的是所谓《付法藏传》，又名《付法藏因缘传》。它的作者说法不一，据宗密说，当为西域贤圣所集。它前后共被译过三次，第一次是刘宋文帝时由释宝云译出，名《付法藏经》；第二次是北魏文成帝和平三年(462)由释昙曜译出；第三次是北魏孝文帝延兴二年(472)由西域沙门吉迦夜译出。《付法藏传》记述了释迦牟尼逝世后其嫡传弟子摩诃迦叶、阿难、商那和修、优婆毱多、提多迦、弥遮迦、佛陀难提、佛陀蜜多、胁尊者、富那奢、马呜、比罗、龙树、迦那提婆、罗睺罗、僧伽难提、僧伽耶舍、鸠摩罗驮、阇夜多、婆修槃陀、祖摩奴罗、鹤勒那、师子的传法世系。　　　　《付法藏传》译出后，天台宗创始人智□便以它为基础，在他所著的《摩诃止观》一书中，陈述了西天二十四祖，始于迦叶终于师子，加上末田地，仍计二十四人。但禅宗系统的僧侣则否认天台宗所信奉的《付法藏传》二十四祖之说，提出了另一世系，即西天二十八祖说。　　　　二十八祖说始于唐代释智炬的《宝林传》。天台宗人宣称，《宝林传》所列最后四祖的名字是杜撰的。他们说，因为智炬看到《达摩多罗禅经》中列有九人，第八名达摩多罗，第九名般若密多罗，于是就在达摩上增菩提二字，把菩提达摩移居般若密多罗之后，又取其他地方二人的名字婆舍斯多和不如密多置于第二十四祖后，便成了二十八人(仍以摩诃迦叶为初祖)。至宋初《景德传灯录》撰成，禅宗二十八祖说逐渐定型。契嵩著书，是对二十八祖说的再次肯定。他的著作因受仁宗皇帝敕赐入藏的优礼，最终使该说成为定论。为菩提达摩的祖位寻找更为充实的理由，《景德传灯录》于菩提达摩名下注曰：本名菩提多罗；《正宗记》又改曰初名菩提多罗，亦号达摩多罗，并于《定祖图》菩提达摩名下注曰：其名称呼不同，如达摩多罗，凡三四说。　　　　宋代天台宗僧侣子防、从义等人从本宗立场出发，曾对禅宗定祖说予以激烈反对。他们不仅认为二十八祖没有根据，而且连带指出禅宗所传拈花微笑、只履西归、立雪断臂等故事也纯属虚构。天台宗重视止观双修，为了突出自宗的渊源流长，他们把学统上溯到印度龙树。因此，天台宗和禅宗不仅在禅法上，而且在祖统上发生矛盾，丝毫不难理解。事实上，无论是天台宗的二十四祖说，还是禅宗的二十八祖说，都缺乏事实依据。宋人陈舜俞《明教大师行业记》指出，契嵩撰《正宗记》和《定祖图》，乃是慨然悯禅门之凌迟。但是，从加强宗派地位的角度看，契嵩的定祖说，对禅宗有重要的贡献。　　　　云门宗自南宋起开始衰微，至元初其法系已无从查考。